Вопрос: Есть ли возможность ввода серийного номера\комментария к товару в момент продажи?

Да. В кассовой программе GBS.Market можно включить в карточке категории товаров запрос дополнительной информации (комментарий, серийный номер) в момент добавления такого товара в чек.